MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria innocua Clip11262

Total Repeats: 8812

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003212	TAAT	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003212	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_003212	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003212	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003212	G	6	6	307	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003212	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_003212	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003212	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003212	A	7	7	1849	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003212	A	6	6	3020	3025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003212	T	7	7	3056	3062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003212	TAA	2	6	4472	4477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003212	A	7	7	4476	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003212	T	8	8	4505	4512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003212	AATA	2	8	4513	4520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003212	C	6	6	4525	4530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_003212	A	7	7	4543	4549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003212	AT	3	6	4562	4567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003212	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003212	A	7	7	4621	4627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003212	TGA	2	6	6000	6005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003212	AAAG	2	8	6007	6014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003212	AAT	2	6	6023	6028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003212	TAA	2	6	7987	7992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003212	TTA	2	6	7998	8003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003212	T	7	7	10644	10650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003212	A	6	6	10707	10712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003212	A	7	7	12824	12830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003212	TAA	2	6	12837	12842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003212	A	6	6	12853	12858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003212	TAT	2	6	12887	12892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003212	AGC	2	6	15882	15887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_003212	AAAT	2	8	15894	15901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003212	T	6	6	15912	15917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003212	AT	3	6	15976	15981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003212	A	6	6	16065	16070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003212	T	6	6	16081	16086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003212	T	6	6	16109	16114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003212	CTT	2	6	16139	16144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_003212	G	6	6	17328	17333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003212	A	6	6	20259	20264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003212	T	7	7	20295	20301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003212	A	7	7	20331	20337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003212	ATT	2	6	20345	20350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003212	GAG	2	6	20408	20413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003212	TGA	2	6	21882	21887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003212	TTAT	2	8	22751	22758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003212	T	7	7	22765	22771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003212	GAAAA	2	10	22777	22786	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003212	TTA	2	6	22845	22850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003212	CG	3	6	22937	22942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_003212	TAA	2	6	24613	24618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003212	GGA	2	6	26252	26257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003212	CG	3	6	26980	26985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_003212	GTT	2	6	26995	27000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003212	T	6	6	27008	27013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003212	A	8	8	27680	27687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003212	A	7	7	27691	27697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003212	AT	3	6	27723	27728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003212	TCA	2	6	27734	27739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_003212	A	6	6	27840	27845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003212	AGGA	2	8	27854	27861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003212	GTC	2	6	27863	27868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_003212	TAA	2	6	29781	29786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003212	T	7	7	30874	30880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003212	T	6	6	30907	30912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003212	A	7	7	31305	31311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003212	T	7	7	31330	31336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003212	CCTT	2	8	32153	32160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_003212	A	6	6	33318	33323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003212	CAA	2	6	33373	33378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_003212	AAGT	2	8	39269	39276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003212	T	6	6	39292	39297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003212	AC	3	6	39298	39303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_003212	GTAA	2	8	39319	39326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003212	ATT	2	6	39342	39347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003212	ATAA	2	8	39356	39363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003212	GACTTT	2	12	39406	39417	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_003212	A	6	6	39419	39424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003212	AGTG	2	8	39433	39440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003212	T	8	8	40113	40120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003212	ATA	2	6	41544	41549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003212	ATT	2	6	41571	41576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003212	GCTC	2	8	41581	41588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_003212	AGG	2	6	41673	41678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003212	GAG	2	6	42021	42026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003212	AGG	2	6	42607	42612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003212	ATTT	2	8	42882	42889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003212	T	6	6	42898	42903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003212	GGA	2	6	42924	42929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003212	A	7	7	42990	42996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003212	CAA	2	6	43008	43013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_003212	ATT	2	6	43649	43654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003212	T	7	7	43669	43675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003212	AAT	2	6	43679	43684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003212	A	6	6	43768	43773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003212	TAAAA	2	10	44674	44683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003212	GGA	2	6	44727	44732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003212	GAT	2	6	46043	46048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003212	T	7	7	46800	46806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003212	TGA	2	6	46828	46833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003212	ATA	2	6	46854	46859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003212	TGA	2	6	46861	46866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003212	GTTA	2	8	46870	46877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003212	TTATG	2	10	46881	46890	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003212	A	7	7	46924	46930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003212	TTTTA	2	10	50793	50802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003212	A	6	6	50858	50863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003212	TGG	2	6	50917	50922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003212	A	6	6	50962	50967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003212	TAC	2	6	52301	52306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_003212	CT	3	6	52315	52320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_003212	T	7	7	52340	52346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003212	TTA	2	6	52351	52356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003212	TTTG	2	8	52450	52457	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003212	TAA	2	6	52503	52508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003212	ATA	2	6	52601	52606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003212	CATA	2	8	52936	52943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_003212	T	6	6	52980	52985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003212	TA	3	6	53031	53036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003212	A	7	7	53036	53042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003212	A	7	7	57040	57046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003212	GAA	2	6	66960	66965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003212	TTA	2	6	66966	66971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003212	A	7	7	67019	67025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003212	CCA	2	6	67026	67031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_003212	AGG	2	6	67087	67092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003212	GTG	2	6	67101	67106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003212	TGT	2	6	67120	67125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003212	AT	3	6	67146	67151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003212	ATG	2	6	67170	67175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003212	A	6	6	67195	67200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003212	AGAA	2	8	67229	67236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003212	AGA	3	9	67394	67402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003212	TAAAA	2	10	67412	67421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003212	AATA	2	8	67497	67504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003212	A	6	6	67852	67857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003212	T	7	7	67950	67956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003212	TCT	2	6	67985	67990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_003212	TA	3	6	68648	68653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003212	AGA	2	6	68711	68716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003212	ATGA	2	8	68762	68769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003212	AAG	2	6	68770	68775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003212	CTGG	2	8	68825	68832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_003212	TAA	2	6	68843	68848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003212	GAA	2	6	68874	68879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003212	CG	3	6	68904	68909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_003212	AC	3	6	68921	68926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_003212	AACC	2	8	69021	69028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_003212	ACC	2	6	69093	69098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_003212	AAAC	2	8	69120	69127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_003212	AAG	2	6	69172	69177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_003212	A	6	6	114809	114814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_003212	TGAA	2	8	114838	114845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
293	NC_003212	ATT	2	6	114874	114879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_003212	CAACA	2	10	114895	114904	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
295	NC_003212	TAA	2	6	114941	114946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_003212	TGA	2	6	114979	114984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NC_003212	ATC	2	6	115062	115067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_003212	AAT	2	6	115147	115152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_003212	AGA	2	6	115165	115170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_003212	AT	3	6	115224	115229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_003212	A	7	7	115260	115266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_003212	A	6	6	117221	117226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_003212	ATA	2	6	125423	125428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_003212	TAA	2	6	131337	131342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_003212	T	6	6	138308	138313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
344	NC_003212	TAA	2	6	138333	138338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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346	NC_003212	T	6	6	138362	138367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
347	NC_003212	TAA	2	6	138482	138487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_003212	A	6	6	180872	180877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_003212	A	8	8	180889	180896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_003212	T	7	7	184128	184134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_003212	A	6	6	184172	184177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_003212	A	6	6	184314	184319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_003212	AGG	2	6	184371	184376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
443	NC_003212	ATT	2	6	184377	184382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_003212	TAG	2	6	186729	186734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_003212	AAT	2	6	195381	195386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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